Jakarta, Jatengaja.com - Varian baru Covid-19 bernama omicron (B.1.1.529) ditetapkan sebagai "varian yang menjadi perhatian" oleh Organisasi Kesehatan Dunia (WHO). Varian omicron dilaporkan oleh para peneliti di Afrika Selatan, 24 November 2021 silam. Menurut para peneliti, Omicron sangat tidak biasa karena sejauh ini merupakan varian yang paling banyak bermutasi dari SARS-CoV-2, virus yang menyebabkan Covid-19.

Varian omicron memiliki 50 mutasi secara keseluruhan, dengan 32 mutasi pada protein spike saja. Protein lonjakan – yang membentuk kenop yang menonjol di bagian luar virus SARS-CoV-2 – membantu virus menempel pada sel sehingga bisa masuk.

Spike juga merupakan protein yang digunakan oleh ketiga vaksin yang saat ini tersedia di Amerika untuk menginduksi antibodi pelindung.

Sebagai perbandingan, varian delta memiliki sembilan mutasi. Jumlah mutasi yang lebih besar dalam varian omicron dapat berarti bahwa itu bisa lebih menular dan/atau lebih baik dalam menghindari perlindungan kekebalan. Prospek yang sangat mengkhawatirkan.

• Pojok Baca Digital, Ikhtiar Tingkatkan Literasi di Salatiga
• Ujian Tatap Muka, Wali Kota Semarang Wanti-wanti Prokes
• Ada Lowongan Kerja PT Telkom, Ini Syaratnya

Suresh V. Kuchipudi,seorang profesor of emerging infectious diseases di Penn State University dalam tulisannya di The Conversation telah mempelajari berbagai aspek virus COVID-19, termasuk penyebarannya ke hewan. Berikut beberapa hal yang dia jelaskan

Mengapa Varian Baru SARS-CoV-2 Terus Muncul?

Meski jumlah mutasi yang luar biasa tinggi pada varian omicron mengejutkan, kemunculan varian SARS-CoV-2 lainnya tidak terduga.

Melalui seleksi alam, mutasi acak terakumulasi dalam virus apapun. Proses ini dipercepat pada virus RNA, termasuk SARS-CoV-2. Jika dan ketika satu set mutasi memberikan keuntungan bertahan hidup pada suatu varian dibandingkan pendahulunya, varian tersebut akan bersaing dengan semua varian virus lain yang ada.

Apakah jumlah mutasi varian omicron yang lebih besar berarti lebih berbahaya dan menular daripada delta? “Kami belum tahu. Kondisi yang menyebabkan munculnya varian tersebut masih belum jelas, tetapi yang jelas adalah jumlah dan konfigurasi mutasi pada omicron yang tidak biasa,” katanya.

Satu penjelasan yang mungkin tentang bagaimana varian virus dengan banyak mutasi muncul adalah melalui infeksi yang berkepanjangan pada pasien yang sistem kekebalannya ditekan. Situasi yang dapat menyebabkan evolusi virus yang cepat.

Para peneliti telah berhipotesis bahwa beberapa varian SARS-CoV-2 sebelumnya, seperti varian alfa, mungkin berasal dari pasien yang terus-menerus terinfeksi. Namun, konstelasi yang tidak biasa dan banyak mutasi pada varian omicron dibuat sangat berbeda dari semua strain SARS-CoV-2 lainnya. Ini merupakan pertanyaan tentang bagaimana kemunculannya.

Sumber varian lain yang mungkin bisa melalui inang hewan. Virus penyebab COVID-19 dapat menginfeksi beberapa spesies hewan, antara lain harimau, singa, kucing, dan anjing. Dalam sebuah penelitian yang belum ditinjau oleh rekan sejawat, tim internasional yang dia pimpin baru-baru ini melaporkan infeksi yang meluas oleh SARS-CoV-2 pada rusa berekor putih yang hidup bebas dan penangkaran di Amerika. Oleh karena itu, pra peneliti juga tidak dapat mengesampingkan kemungkinan bahwa varian omicron muncul pada inang hewan melalui evolusi yang cepat.

Bagaimana Varian Delta Menjadi Dominan di Seluruh Dunia

Delta antara 40 persen dan 60 persen lebih mudah menular daripada varian alfa dan hampir dua kali lebih mudah menular dari virus SARS-CoV-2 asli yang pertama kali diidentifikasi di China. Penularan varian delta yang meningkat adalah alasan utama mengapa para peneliti percaya bahwa varian tersebut mampu bersaing dengan varian lain untuk menjadi strain yang dominan.

• Muh. Haris : Gema Keadilan Wadah Tempa Pemuda Calon Pemimpin Indonesia
• Ganjar Luncurkan Kredit Lapak Khusus Emak-Emak Pedagang Pasar Bunga 2% Setahun
• Libatkan Warga, Perpustakaan Patriot Probolinggo Makin Terkenal di Jatim

Faktor kunci dalam kebugaran virus adalah tingkat replikasinya — atau seberapa cepat virus dapat membuat lebih banyak salinan dari dirinya sendiri. Varian delta bereplikasi lebih cepat daripada varian SARS-CoV-2 sebelumnya, dan sebuah studi yang belum ditinjau sejawat memperkirakan bahwa ia menghasilkan 1.000 kali lebih banyak partikel virus daripada pendahulunya.

Selain itu orang yang terinfeksi varian delta membuat dan mengeluarkan lebih banyak virus yang merupakan mekanisme potensial lain untuk meningkatkan kemampuannya untuk menyebar. “Penelitian menunjukkan bahwa penjelasan yang mungkin untuk peningkatan kemampuan varian delta untuk bereplikasi adalah bahwa mutasi pada protein spike menyebabkan pengikatan protein spike yang lebih efisien ke inangnya, melalui reseptor ACE-2.”

Varian delta juga telah memperoleh mutasi yang memungkinkannya menghindari antibodi penetralisir yang berperan penting dalam pertahanan tubuh melawan virus yang menyerang. Ini bisa menjelaskan mengapa, seperti yang ditunjukkan oleh banyak laporan, vaksin COVID-19 agak kurang efektif terhadap varian delta.

Kombinasi dari transmisibilitas tinggi dan penghindaran kekebalan ini dapat membantu menjelaskan bagaimana varian delta menjadi begitu tinggi.

Studi juga menunjukkan bahwa orang yang terinfeksi varian delta memiliki risiko lebih tinggi untuk dirawat di rumah sakit dibandingkan dengan mereka yang terinfeksi SARS-CoV-2 asli dan varian awal. Satu mutasi khusus pada protein lonjakan varian delta – mutasi P681R – dianggap sebagai kontributor utama untuk peningkatan kemampuannya memasuki sel dan menyebabkan penyakit yang lebih parah.

Akankah Omicron Menggantikan Delta?

Terlalu dini untuk mengatakan apakah varian omicron lebih kuat daripada delta atau akan menjadi dominan. Omicron berbagi beberapa mutasi dengan varian delta tetapi juga memiliki hal lain yang sangat berbeda.

Tetapi salah satu alasan mengapa di komunitas penelitian Suresh V. Kuchipudi sangat khawatir adalah bahwa varian omicron memiliki 10 mutasi pada domain pengikatan reseptor atau bagian dari protein lonjakan yang berinteraksi dengan reseptor ACE-2 dan memediasi masuknya ke dalam sel. Angka ini jauh dibandingkan dengan hanya dua untuk varian delta.

Misalkan kombinasi dari semua mutasi pada omicron membuatnya lebih menular atau lebih baik pada penghindaran imun daripada delta. “Dalam hal ini, kita bisa melihat penyebaran varian ini secara global. Namun, mungkin juga jumlah mutasi yang luar biasa tinggi dapat merusak virus dan membuatnya tidak stabil,” katanya.

• Pojok Baca Digital, Ikhtiar Tingkatkan Literasi di Salatiga
• Ujian Tatap Muka, Wali Kota Semarang Wanti-wanti Prokes

Sangat mungkin bahwa varian omicron bukanlah akhir permainan dan lebih banyak varian SARS-CoV-2 akan muncul. Karena SARS-CoV-2 terus menyebar di antara manusia, seleksi alam dan adaptasi akan menghasilkan lebih banyak varian yang masuk akal lebih mudah menular daripada delta.

“Kita tahu dari virus influenza bahwa proses adaptasi virus tidak pernah berakhir. Tingkat vaksinasi yang lebih rendah di antara banyak negara berarti bahwa masih ada banyak inang yang rentan di luar sana untuk virus tersebut, dan virus itu akan terus beredar dan bermutasi selama masih dapat menyebar,” katanya.

Dia menegegaskan munculnya varian omicron adalah pengingat lain tentang urgensi vaksinasi untuk menghentikan penyebaran dan evolusi SARS-CoV-2 lebih lanjut.

Tulisan ini telah tayang di www.trenasia.com oleh Amirudin Zuhri pada 03 Dec 2021